Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP19O94966 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP19O94966 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
USP19O94966 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP19O94966 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP19O94966 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP19O94966 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP19O94966 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
USP19O94966 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP19O94966 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP19O94966 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP19O94966 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP19O94966 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
USP19O94966 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP19O94966 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP19O94966 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP19O94966 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
USP19O94966 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP19O94966 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP19O94966 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP19O94966 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP19O94966 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP19O94966 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP19O94966 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP19O94966 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP19O94966 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP19O94966 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP19O94966 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
USP19O94966 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP19O94966 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
USP19O94966 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP19O94966 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP19O94966 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP19O94966 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.48
USP19O94966 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP19O94966 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP19O94966 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP19O94966 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
USP19O94966 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP19O94966 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP19O94966 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP19O94966 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP19O94966 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP19O94966 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP19O94966 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP19O94966 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP19O94966 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP19O94966 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP19O94966 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP19O94966 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP19O94966 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP19O94966 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP19O94966 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP19O94966 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP19O94966 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
USP19O94966 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms