Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASA4O43374 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASA4O43374 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RASA4O43374 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASA4O43374 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASA4O43374 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASA4O43374 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASA4O43374 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASA4O43374 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RASA4O43374 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASA4O43374 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASA4O43374 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASA4O43374 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASA4O43374 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASA4O43374 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RASA4O43374 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASA4O43374 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASA4O43374 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASA4O43374 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASA4O43374 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASA4O43374 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASA4O43374 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASA4O43374 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASA4O43374 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASA4O43374 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASA4O43374 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASA4O43374 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASA4O43374 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASA4O43374 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASA4O43374 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASA4O43374 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASA4O43374 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASA4O43374 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASA4O43374 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASA4O43374 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASA4O43374 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASA4O43374 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASA4O43374 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASA4O43374 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASA4O43374 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASA4O43374 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASA4O43374 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASA4O43374 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASA4O43374 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASA4O43374 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASA4O43374 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASA4O43374 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASA4O43374 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASA4O43374 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASA4O43374 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASA4O43374 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASA4O43374 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASA4O43374 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASA4O43374 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASA4O43374 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASA4O43374 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASA4O43374 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASA4O43374 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASA4O43374 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASA4O43374 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASA4O43374 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASA4O43374 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASA4O43374 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASA4O43374 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms