Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01549A6NIU2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms