Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ITSN2Q9NZM3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
ITSN2Q9NZM3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
ITSN2Q9NZM3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
ITSN2Q9NZM3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ITSN2Q9NZM3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ITSN2Q9NZM3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
ITSN2Q9NZM3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ITSN2Q9NZM3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
ITSN2Q9NZM3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ITSN2Q9NZM3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
ITSN2Q9NZM3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ITSN2Q9NZM3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ITSN2Q9NZM3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
ITSN2Q9NZM3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ITSN2Q9NZM3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ITSN2Q9NZM3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ITSN2Q9NZM3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
ITSN2Q9NZM3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ITSN2Q9NZM3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
ITSN2Q9NZM3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
ITSN2Q9NZM3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
ITSN2Q9NZM3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ITSN2Q9NZM3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ITSN2Q9NZM3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
ITSN2Q9NZM3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
ITSN2Q9NZM3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
ITSN2Q9NZM3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ITSN2Q9NZM3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
ITSN2Q9NZM3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ITSN2Q9NZM3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ITSN2Q9NZM3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ITSN2Q9NZM3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ITSN2Q9NZM3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ITSN2Q9NZM3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.89■■■■■ 4.46
ITSN2Q9NZM3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ITSN2Q9NZM3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ITSN2Q9NZM3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ITSN2Q9NZM3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
ITSN2Q9NZM3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ITSN2Q9NZM3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ITSN2Q9NZM3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
ITSN2Q9NZM3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ITSN2Q9NZM3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ITSN2Q9NZM3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
ITSN2Q9NZM3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
ITSN2Q9NZM3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.43
ITSN2Q9NZM3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
ITSN2Q9NZM3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
ITSN2Q9NZM3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ITSN2Q9NZM3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ITSN2Q9NZM3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ITSN2Q9NZM3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ITSN2Q9NZM3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ITSN2Q9NZM3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ITSN2Q9NZM3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
ITSN2Q9NZM3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
ITSN2Q9NZM3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
ITSN2Q9NZM3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
ITSN2Q9NZM3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
ITSN2Q9NZM3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
ITSN2Q9NZM3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ITSN2Q9NZM3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ITSN2Q9NZM3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ITSN2Q9NZM3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
ITSN2Q9NZM3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ITSN2Q9NZM3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ITSN2Q9NZM3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ITSN2Q9NZM3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
ITSN2Q9NZM3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
ITSN2Q9NZM3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
ITSN2Q9NZM3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
ITSN2Q9NZM3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.39
ITSN2Q9NZM3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ITSN2Q9NZM3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ITSN2Q9NZM3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ITSN2Q9NZM3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
ITSN2Q9NZM3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
ITSN2Q9NZM3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
ITSN2Q9NZM3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
ITSN2Q9NZM3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
ITSN2Q9NZM3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
ITSN2Q9NZM3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ITSN2Q9NZM3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
ITSN2Q9NZM3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ITSN2Q9NZM3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ITSN2Q9NZM3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
ITSN2Q9NZM3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ITSN2Q9NZM3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
ITSN2Q9NZM3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ITSN2Q9NZM3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ITSN2Q9NZM3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ITSN2Q9NZM3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ITSN2Q9NZM3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
ITSN2Q9NZM3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ITSN2Q9NZM3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ITSN2Q9NZM3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
ITSN2Q9NZM3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ITSN2Q9NZM3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
ITSN2Q9NZM3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms