Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CDK12Q9NYV4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CDK12Q9NYV4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CDK12Q9NYV4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CDK12Q9NYV4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CDK12Q9NYV4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CDK12Q9NYV4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
CDK12Q9NYV4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CDK12Q9NYV4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CDK12Q9NYV4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK12Q9NYV4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK12Q9NYV4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CDK12Q9NYV4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CDK12Q9NYV4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CDK12Q9NYV4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CDK12Q9NYV4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CDK12Q9NYV4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CDK12Q9NYV4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CDK12Q9NYV4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
CDK12Q9NYV4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CDK12Q9NYV4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CDK12Q9NYV4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CDK12Q9NYV4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CDK12Q9NYV4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CDK12Q9NYV4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CDK12Q9NYV4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CDK12Q9NYV4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
CDK12Q9NYV4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CDK12Q9NYV4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CDK12Q9NYV4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CDK12Q9NYV4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK12Q9NYV4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CDK12Q9NYV4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CDK12Q9NYV4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CDK12Q9NYV4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
CDK12Q9NYV4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK12Q9NYV4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK12Q9NYV4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK12Q9NYV4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK12Q9NYV4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK12Q9NYV4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK12Q9NYV4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CDK12Q9NYV4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CDK12Q9NYV4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CDK12Q9NYV4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK12Q9NYV4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK12Q9NYV4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK12Q9NYV4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CDK12Q9NYV4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CDK12Q9NYV4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CDK12Q9NYV4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CDK12Q9NYV4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK12Q9NYV4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK12Q9NYV4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CDK12Q9NYV4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK12Q9NYV4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CDK12Q9NYV4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CDK12Q9NYV4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CDK12Q9NYV4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CDK12Q9NYV4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK12Q9NYV4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK12Q9NYV4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK12Q9NYV4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK12Q9NYV4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CDK12Q9NYV4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CDK12Q9NYV4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CDK12Q9NYV4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CDK12Q9NYV4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CDK12Q9NYV4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CDK12Q9NYV4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CDK12Q9NYV4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CDK12Q9NYV4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CDK12Q9NYV4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CDK12Q9NYV4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CDK12Q9NYV4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CDK12Q9NYV4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CDK12Q9NYV4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CDK12Q9NYV4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CDK12Q9NYV4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CDK12Q9NYV4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CDK12Q9NYV4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CDK12Q9NYV4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CDK12Q9NYV4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CDK12Q9NYV4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
CDK12Q9NYV4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CDK12Q9NYV4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CDK12Q9NYV4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CDK12Q9NYV4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CDK12Q9NYV4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CDK12Q9NYV4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CDK12Q9NYV4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CDK12Q9NYV4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK12Q9NYV4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDK12Q9NYV4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDK12Q9NYV4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDK12Q9NYV4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDK12Q9NYV4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CDK12Q9NYV4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms