Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASF1BQ9NVP2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASF1BQ9NVP2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASF1BQ9NVP2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ASF1BQ9NVP2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASF1BQ9NVP2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASF1BQ9NVP2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASF1BQ9NVP2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASF1BQ9NVP2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASF1BQ9NVP2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASF1BQ9NVP2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASF1BQ9NVP2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASF1BQ9NVP2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ASF1BQ9NVP2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASF1BQ9NVP2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASF1BQ9NVP2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASF1BQ9NVP2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASF1BQ9NVP2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASF1BQ9NVP2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASF1BQ9NVP2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASF1BQ9NVP2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASF1BQ9NVP2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASF1BQ9NVP2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASF1BQ9NVP2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ASF1BQ9NVP2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ASF1BQ9NVP2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASF1BQ9NVP2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASF1BQ9NVP2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASF1BQ9NVP2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ASF1BQ9NVP2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASF1BQ9NVP2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ASF1BQ9NVP2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASF1BQ9NVP2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASF1BQ9NVP2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASF1BQ9NVP2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ASF1BQ9NVP2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASF1BQ9NVP2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASF1BQ9NVP2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ASF1BQ9NVP2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASF1BQ9NVP2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASF1BQ9NVP2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASF1BQ9NVP2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASF1BQ9NVP2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASF1BQ9NVP2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASF1BQ9NVP2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASF1BQ9NVP2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASF1BQ9NVP2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASF1BQ9NVP2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASF1BQ9NVP2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms