Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM138Q9NPI0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM138Q9NPI0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM138Q9NPI0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM138Q9NPI0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM138Q9NPI0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM138Q9NPI0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM138Q9NPI0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM138Q9NPI0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM138Q9NPI0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM138Q9NPI0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM138Q9NPI0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM138Q9NPI0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM138Q9NPI0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM138Q9NPI0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM138Q9NPI0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM138Q9NPI0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM138Q9NPI0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM138Q9NPI0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM138Q9NPI0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM138Q9NPI0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM138Q9NPI0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM138Q9NPI0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM138Q9NPI0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM138Q9NPI0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM138Q9NPI0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM138Q9NPI0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM138Q9NPI0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM138Q9NPI0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM138Q9NPI0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM138Q9NPI0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM138Q9NPI0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM138Q9NPI0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM138Q9NPI0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM138Q9NPI0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM138Q9NPI0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM138Q9NPI0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM138Q9NPI0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM138Q9NPI0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM138Q9NPI0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM138Q9NPI0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM138Q9NPI0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM138Q9NPI0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM138Q9NPI0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms