Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNDIG1Q9H7V2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNDIG1Q9H7V2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNDIG1Q9H7V2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNDIG1Q9H7V2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNDIG1Q9H7V2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNDIG1Q9H7V2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNDIG1Q9H7V2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNDIG1Q9H7V2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNDIG1Q9H7V2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNDIG1Q9H7V2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNDIG1Q9H7V2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNDIG1Q9H7V2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNDIG1Q9H7V2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNDIG1Q9H7V2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNDIG1Q9H7V2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNDIG1Q9H7V2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNDIG1Q9H7V2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNDIG1Q9H7V2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNDIG1Q9H7V2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNDIG1Q9H7V2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNDIG1Q9H7V2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNDIG1Q9H7V2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNDIG1Q9H7V2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNDIG1Q9H7V2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNDIG1Q9H7V2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNDIG1Q9H7V2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNDIG1Q9H7V2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNDIG1Q9H7V2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNDIG1Q9H7V2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNDIG1Q9H7V2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNDIG1Q9H7V2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNDIG1Q9H7V2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNDIG1Q9H7V2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNDIG1Q9H7V2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNDIG1Q9H7V2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNDIG1Q9H7V2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNDIG1Q9H7V2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNDIG1Q9H7V2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNDIG1Q9H7V2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNDIG1Q9H7V2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNDIG1Q9H7V2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNDIG1Q9H7V2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNDIG1Q9H7V2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNDIG1Q9H7V2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNDIG1Q9H7V2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNDIG1Q9H7V2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNDIG1Q9H7V2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNDIG1Q9H7V2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNDIG1Q9H7V2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNDIG1Q9H7V2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNDIG1Q9H7V2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNDIG1Q9H7V2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNDIG1Q9H7V2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNDIG1Q9H7V2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNDIG1Q9H7V2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNDIG1Q9H7V2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNDIG1Q9H7V2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNDIG1Q9H7V2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNDIG1Q9H7V2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNDIG1Q9H7V2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNDIG1Q9H7V2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNDIG1Q9H7V2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNDIG1Q9H7V2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNDIG1Q9H7V2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNDIG1Q9H7V2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNDIG1Q9H7V2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNDIG1Q9H7V2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNDIG1Q9H7V2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNDIG1Q9H7V2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNDIG1Q9H7V2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms