Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI7

PSD2, PH and SEC7 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD2Q9BQI7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSD2Q9BQI7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSD2Q9BQI7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSD2Q9BQI7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSD2Q9BQI7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSD2Q9BQI7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSD2Q9BQI7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSD2Q9BQI7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSD2Q9BQI7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSD2Q9BQI7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSD2Q9BQI7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSD2Q9BQI7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSD2Q9BQI7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSD2Q9BQI7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSD2Q9BQI7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSD2Q9BQI7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSD2Q9BQI7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSD2Q9BQI7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSD2Q9BQI7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSD2Q9BQI7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSD2Q9BQI7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSD2Q9BQI7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSD2Q9BQI7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSD2Q9BQI7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSD2Q9BQI7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD2Q9BQI7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD2Q9BQI7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD2Q9BQI7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSD2Q9BQI7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSD2Q9BQI7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSD2Q9BQI7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSD2Q9BQI7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSD2Q9BQI7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSD2Q9BQI7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSD2Q9BQI7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSD2Q9BQI7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSD2Q9BQI7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSD2Q9BQI7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSD2Q9BQI7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSD2Q9BQI7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSD2Q9BQI7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSD2Q9BQI7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSD2Q9BQI7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSD2Q9BQI7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD2Q9BQI7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms