Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX50Q9BQ39 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX50Q9BQ39 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX50Q9BQ39 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX50Q9BQ39 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX50Q9BQ39 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX50Q9BQ39 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX50Q9BQ39 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX50Q9BQ39 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX50Q9BQ39 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX50Q9BQ39 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX50Q9BQ39 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX50Q9BQ39 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX50Q9BQ39 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX50Q9BQ39 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX50Q9BQ39 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX50Q9BQ39 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX50Q9BQ39 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX50Q9BQ39 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX50Q9BQ39 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX50Q9BQ39 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX50Q9BQ39 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX50Q9BQ39 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX50Q9BQ39 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX50Q9BQ39 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX50Q9BQ39 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX50Q9BQ39 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX50Q9BQ39 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX50Q9BQ39 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX50Q9BQ39 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX50Q9BQ39 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX50Q9BQ39 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX50Q9BQ39 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX50Q9BQ39 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX50Q9BQ39 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX50Q9BQ39 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms