Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RETNLBQ9BQ08 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RETNLBQ9BQ08 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RETNLBQ9BQ08 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RETNLBQ9BQ08 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RETNLBQ9BQ08 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RETNLBQ9BQ08 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RETNLBQ9BQ08 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RETNLBQ9BQ08 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RETNLBQ9BQ08 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RETNLBQ9BQ08 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RETNLBQ9BQ08 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RETNLBQ9BQ08 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RETNLBQ9BQ08 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RETNLBQ9BQ08 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RETNLBQ9BQ08 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms