Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ELF4Q99607 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ELF4Q99607 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ELF4Q99607 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ELF4Q99607 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ELF4Q99607 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ELF4Q99607 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ELF4Q99607 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ELF4Q99607 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ELF4Q99607 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ELF4Q99607 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ELF4Q99607 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ELF4Q99607 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ELF4Q99607 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ELF4Q99607 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ELF4Q99607 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ELF4Q99607 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ELF4Q99607 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ELF4Q99607 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ELF4Q99607 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ELF4Q99607 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ELF4Q99607 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ELF4Q99607 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELF4Q99607 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELF4Q99607 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELF4Q99607 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELF4Q99607 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELF4Q99607 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ELF4Q99607 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELF4Q99607 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELF4Q99607 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELF4Q99607 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELF4Q99607 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELF4Q99607 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELF4Q99607 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELF4Q99607 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELF4Q99607 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELF4Q99607 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ELF4Q99607 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELF4Q99607 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELF4Q99607 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELF4Q99607 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELF4Q99607 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ELF4Q99607 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELF4Q99607 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ELF4Q99607 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ELF4Q99607 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ELF4Q99607 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ELF4Q99607 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ELF4Q99607 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ELF4Q99607 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ELF4Q99607 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ELF4Q99607 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ELF4Q99607 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELF4Q99607 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELF4Q99607 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELF4Q99607 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ELF4Q99607 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ELF4Q99607 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ELF4Q99607 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ELF4Q99607 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ELF4Q99607 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ELF4Q99607 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ELF4Q99607 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ELF4Q99607 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms