Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB1CQ92928 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB1CQ92928 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB1CQ92928 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB1CQ92928 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB1CQ92928 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB1CQ92928 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB1CQ92928 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB1CQ92928 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB1CQ92928 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB1CQ92928 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB1CQ92928 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB1CQ92928 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB1CQ92928 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB1CQ92928 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB1CQ92928 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB1CQ92928 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB1CQ92928 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB1CQ92928 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB1CQ92928 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB1CQ92928 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB1CQ92928 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB1CQ92928 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB1CQ92928 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB1CQ92928 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB1CQ92928 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB1CQ92928 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB1CQ92928 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB1CQ92928 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms