Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCN1Q92616 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCN1Q92616 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCN1Q92616 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCN1Q92616 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCN1Q92616 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCN1Q92616 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCN1Q92616 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCN1Q92616 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GCN1Q92616 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCN1Q92616 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCN1Q92616 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCN1Q92616 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCN1Q92616 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GCN1Q92616 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCN1Q92616 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCN1Q92616 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GCN1Q92616 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCN1Q92616 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCN1Q92616 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCN1Q92616 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCN1Q92616 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCN1Q92616 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCN1Q92616 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCN1Q92616 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCN1Q92616 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCN1Q92616 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCN1Q92616 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCN1Q92616 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GCN1Q92616 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCN1Q92616 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCN1Q92616 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GCN1Q92616 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCN1Q92616 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCN1Q92616 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCN1Q92616 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCN1Q92616 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCN1Q92616 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCN1Q92616 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCN1Q92616 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCN1Q92616 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCN1Q92616 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCN1Q92616 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GCN1Q92616 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCN1Q92616 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCN1Q92616 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCN1Q92616 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCN1Q92616 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCN1Q92616 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GCN1Q92616 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCN1Q92616 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCN1Q92616 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCN1Q92616 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCN1Q92616 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCN1Q92616 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCN1Q92616 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCN1Q92616 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCN1Q92616 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCN1Q92616 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCN1Q92616 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCN1Q92616 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCN1Q92616 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCN1Q92616 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCN1Q92616 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCN1Q92616 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCN1Q92616 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCN1Q92616 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCN1Q92616 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCN1Q92616 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GCN1Q92616 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCN1Q92616 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCN1Q92616 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GCN1Q92616 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCN1Q92616 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCN1Q92616 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCN1Q92616 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCN1Q92616 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCN1Q92616 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCN1Q92616 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCN1Q92616 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCN1Q92616 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCN1Q92616 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCN1Q92616 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCN1Q92616 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCN1Q92616 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCN1Q92616 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCN1Q92616 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
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