Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ5

TNIP2, TNFAIP3-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2Q8NFZ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNIP2Q8NFZ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNIP2Q8NFZ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNIP2Q8NFZ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNIP2Q8NFZ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNIP2Q8NFZ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNIP2Q8NFZ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNIP2Q8NFZ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNIP2Q8NFZ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNIP2Q8NFZ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNIP2Q8NFZ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNIP2Q8NFZ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNIP2Q8NFZ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNIP2Q8NFZ5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNIP2Q8NFZ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNIP2Q8NFZ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP2Q8NFZ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP2Q8NFZ5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP2Q8NFZ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP2Q8NFZ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNIP2Q8NFZ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNIP2Q8NFZ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNIP2Q8NFZ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNIP2Q8NFZ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNIP2Q8NFZ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNIP2Q8NFZ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNIP2Q8NFZ5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP2Q8NFZ5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNIP2Q8NFZ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNIP2Q8NFZ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNIP2Q8NFZ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNIP2Q8NFZ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNIP2Q8NFZ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP2Q8NFZ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP2Q8NFZ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNIP2Q8NFZ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNIP2Q8NFZ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNIP2Q8NFZ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNIP2Q8NFZ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNIP2Q8NFZ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNIP2Q8NFZ5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNIP2Q8NFZ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNIP2Q8NFZ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNIP2Q8NFZ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNIP2Q8NFZ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNIP2Q8NFZ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNIP2Q8NFZ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms