Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf54Q8N8G6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf54Q8N8G6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C15orf54Q8N8G6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C15orf54Q8N8G6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf54Q8N8G6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf54Q8N8G6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf54Q8N8G6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C15orf54Q8N8G6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C15orf54Q8N8G6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C15orf54Q8N8G6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C15orf54Q8N8G6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C15orf54Q8N8G6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C15orf54Q8N8G6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C15orf54Q8N8G6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf54Q8N8G6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf54Q8N8G6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf54Q8N8G6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf54Q8N8G6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf54Q8N8G6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C15orf54Q8N8G6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C15orf54Q8N8G6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C15orf54Q8N8G6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C15orf54Q8N8G6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C15orf54Q8N8G6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C15orf54Q8N8G6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C15orf54Q8N8G6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C15orf54Q8N8G6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C15orf54Q8N8G6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms