Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM15Q7Z3B0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM15Q7Z3B0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM15Q7Z3B0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM15Q7Z3B0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM15Q7Z3B0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM15Q7Z3B0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM15Q7Z3B0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM15Q7Z3B0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM15Q7Z3B0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM15Q7Z3B0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM15Q7Z3B0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM15Q7Z3B0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM15Q7Z3B0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM15Q7Z3B0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMIM15Q7Z3B0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM15Q7Z3B0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM15Q7Z3B0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms