Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Q71RC1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q71RC1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q71RC1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q71RC1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q71RC1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q71RC1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q71RC1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q71RC1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q71RC1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q71RC1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q71RC1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q71RC1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q71RC1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q71RC1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q71RC1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q71RC1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q71RC1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q71RC1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q71RC1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q71RC1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q71RC1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q71RC1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q71RC1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q71RC1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q71RC1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q71RC1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q71RC1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q71RC1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q71RC1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q71RC1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q71RC1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q71RC1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q71RC1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q71RC1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q71RC1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Q71RC1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q71RC1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q71RC1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Q71RC1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q71RC1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q71RC1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q71RC1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q71RC1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q71RC1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q71RC1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q71RC1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q71RC1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q71RC1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q71RC1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q71RC1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q71RC1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q71RC1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q71RC1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q71RC1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q71RC1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q71RC1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q71RC1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q71RC1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q71RC1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q71RC1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q71RC1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q71RC1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q71RC1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q71RC1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q71RC1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q71RC1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q71RC1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q71RC1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q71RC1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q71RC1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q71RC1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q71RC1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q71RC1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q71RC1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q71RC1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q71RC1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q71RC1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q71RC1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q71RC1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q71RC1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q71RC1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q71RC1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q71RC1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q71RC1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q71RC1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q71RC1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q71RC1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q71RC1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q71RC1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q71RC1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q71RC1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q71RC1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q71RC1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q71RC1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q71RC1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q71RC1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q71RC1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q71RC1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q71RC1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms