Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM208BQ5VWN6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM208BQ5VWN6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM208BQ5VWN6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM208BQ5VWN6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM208BQ5VWN6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM208BQ5VWN6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM208BQ5VWN6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM208BQ5VWN6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM208BQ5VWN6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM208BQ5VWN6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM208BQ5VWN6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM208BQ5VWN6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM208BQ5VWN6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM208BQ5VWN6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM208BQ5VWN6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM208BQ5VWN6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM208BQ5VWN6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM208BQ5VWN6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM208BQ5VWN6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM208BQ5VWN6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM208BQ5VWN6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM208BQ5VWN6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM208BQ5VWN6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM208BQ5VWN6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM208BQ5VWN6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM208BQ5VWN6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM208BQ5VWN6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM208BQ5VWN6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM208BQ5VWN6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM208BQ5VWN6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM208BQ5VWN6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM208BQ5VWN6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM208BQ5VWN6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM208BQ5VWN6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM208BQ5VWN6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM208BQ5VWN6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FAM208BQ5VWN6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM208BQ5VWN6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM208BQ5VWN6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM208BQ5VWN6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM208BQ5VWN6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM208BQ5VWN6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM208BQ5VWN6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM208BQ5VWN6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM208BQ5VWN6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM208BQ5VWN6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM208BQ5VWN6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM208BQ5VWN6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM208BQ5VWN6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM208BQ5VWN6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM208BQ5VWN6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM208BQ5VWN6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM208BQ5VWN6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM208BQ5VWN6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM208BQ5VWN6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM208BQ5VWN6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM208BQ5VWN6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM208BQ5VWN6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM208BQ5VWN6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM208BQ5VWN6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM208BQ5VWN6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM208BQ5VWN6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM208BQ5VWN6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM208BQ5VWN6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM208BQ5VWN6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM208BQ5VWN6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM208BQ5VWN6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM208BQ5VWN6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM208BQ5VWN6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM208BQ5VWN6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM208BQ5VWN6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM208BQ5VWN6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM208BQ5VWN6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM208BQ5VWN6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM208BQ5VWN6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM208BQ5VWN6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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