Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
OBSCNQ5VST9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
OBSCNQ5VST9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
OBSCNQ5VST9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms