Protein–RNA interactions for Protein: Q53ET0

CRTC2, CREB-regulated transcription coactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC2Q53ET0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRTC2Q53ET0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRTC2Q53ET0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CRTC2Q53ET0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRTC2Q53ET0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRTC2Q53ET0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRTC2Q53ET0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRTC2Q53ET0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRTC2Q53ET0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRTC2Q53ET0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRTC2Q53ET0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRTC2Q53ET0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTC2Q53ET0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTC2Q53ET0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRTC2Q53ET0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRTC2Q53ET0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRTC2Q53ET0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRTC2Q53ET0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRTC2Q53ET0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRTC2Q53ET0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRTC2Q53ET0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CRTC2Q53ET0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRTC2Q53ET0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRTC2Q53ET0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRTC2Q53ET0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRTC2Q53ET0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRTC2Q53ET0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRTC2Q53ET0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRTC2Q53ET0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRTC2Q53ET0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRTC2Q53ET0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CRTC2Q53ET0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRTC2Q53ET0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRTC2Q53ET0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRTC2Q53ET0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRTC2Q53ET0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRTC2Q53ET0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRTC2Q53ET0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRTC2Q53ET0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRTC2Q53ET0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRTC2Q53ET0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRTC2Q53ET0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRTC2Q53ET0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRTC2Q53ET0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRTC2Q53ET0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRTC2Q53ET0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRTC2Q53ET0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRTC2Q53ET0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms