Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM249Q2WGJ8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM249Q2WGJ8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM249Q2WGJ8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM249Q2WGJ8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM249Q2WGJ8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM249Q2WGJ8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM249Q2WGJ8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM249Q2WGJ8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM249Q2WGJ8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM249Q2WGJ8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM249Q2WGJ8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM249Q2WGJ8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM249Q2WGJ8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM249Q2WGJ8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM249Q2WGJ8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM249Q2WGJ8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM249Q2WGJ8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM249Q2WGJ8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM249Q2WGJ8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM249Q2WGJ8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM249Q2WGJ8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM249Q2WGJ8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM249Q2WGJ8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM249Q2WGJ8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM249Q2WGJ8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM249Q2WGJ8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM249Q2WGJ8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM249Q2WGJ8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM249Q2WGJ8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM249Q2WGJ8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM249Q2WGJ8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM249Q2WGJ8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM249Q2WGJ8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM249Q2WGJ8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM249Q2WGJ8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM249Q2WGJ8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM249Q2WGJ8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM249Q2WGJ8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM249Q2WGJ8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM249Q2WGJ8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM249Q2WGJ8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms