Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ISXQ2M1V0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ISXQ2M1V0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ISXQ2M1V0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ISXQ2M1V0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ISXQ2M1V0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ISXQ2M1V0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ISXQ2M1V0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ISXQ2M1V0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ISXQ2M1V0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ISXQ2M1V0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ISXQ2M1V0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ISXQ2M1V0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ISXQ2M1V0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ISXQ2M1V0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ISXQ2M1V0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ISXQ2M1V0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ISXQ2M1V0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ISXQ2M1V0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ISXQ2M1V0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ISXQ2M1V0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ISXQ2M1V0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ISXQ2M1V0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ISXQ2M1V0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ISXQ2M1V0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ISXQ2M1V0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ISXQ2M1V0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ISXQ2M1V0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ISXQ2M1V0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ISXQ2M1V0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ISXQ2M1V0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ISXQ2M1V0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ISXQ2M1V0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ISXQ2M1V0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ISXQ2M1V0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ISXQ2M1V0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ISXQ2M1V0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ISXQ2M1V0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ISXQ2M1V0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ISXQ2M1V0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ISXQ2M1V0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ISXQ2M1V0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ISXQ2M1V0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ISXQ2M1V0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISXQ2M1V0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISXQ2M1V0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ISXQ2M1V0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ISXQ2M1V0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISXQ2M1V0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ISXQ2M1V0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISXQ2M1V0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISXQ2M1V0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISXQ2M1V0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISXQ2M1V0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ISXQ2M1V0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ISXQ2M1V0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ISXQ2M1V0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ISXQ2M1V0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ISXQ2M1V0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ISXQ2M1V0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ISXQ2M1V0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ISXQ2M1V0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ISXQ2M1V0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ISXQ2M1V0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ISXQ2M1V0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ISXQ2M1V0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ISXQ2M1V0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ISXQ2M1V0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ISXQ2M1V0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ISXQ2M1V0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ISXQ2M1V0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ISXQ2M1V0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ISXQ2M1V0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ISXQ2M1V0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ISXQ2M1V0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ISXQ2M1V0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ISXQ2M1V0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ISXQ2M1V0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ISXQ2M1V0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ISXQ2M1V0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ISXQ2M1V0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ISXQ2M1V0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ISXQ2M1V0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms