Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF1Q17RB8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF1Q17RB8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF1Q17RB8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LONRF1Q17RB8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LONRF1Q17RB8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LONRF1Q17RB8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LONRF1Q17RB8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF1Q17RB8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LONRF1Q17RB8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LONRF1Q17RB8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LONRF1Q17RB8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LONRF1Q17RB8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LONRF1Q17RB8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LONRF1Q17RB8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LONRF1Q17RB8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LONRF1Q17RB8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LONRF1Q17RB8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LONRF1Q17RB8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LONRF1Q17RB8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LONRF1Q17RB8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LONRF1Q17RB8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LONRF1Q17RB8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LONRF1Q17RB8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LONRF1Q17RB8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LONRF1Q17RB8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LONRF1Q17RB8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LONRF1Q17RB8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LONRF1Q17RB8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LONRF1Q17RB8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF1Q17RB8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LONRF1Q17RB8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LONRF1Q17RB8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LONRF1Q17RB8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LONRF1Q17RB8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LONRF1Q17RB8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LONRF1Q17RB8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LONRF1Q17RB8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF1Q17RB8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF1Q17RB8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF1Q17RB8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LONRF1Q17RB8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LONRF1Q17RB8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF1Q17RB8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LONRF1Q17RB8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LONRF1Q17RB8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LONRF1Q17RB8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LONRF1Q17RB8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LONRF1Q17RB8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LONRF1Q17RB8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LONRF1Q17RB8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF1Q17RB8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LONRF1Q17RB8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF1Q17RB8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF1Q17RB8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LONRF1Q17RB8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF1Q17RB8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
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