Protein–RNA interactions for Protein: Q14190

SIM2, Single-minded homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM2Q14190 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIM2Q14190 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIM2Q14190 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIM2Q14190 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIM2Q14190 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIM2Q14190 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SIM2Q14190 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIM2Q14190 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIM2Q14190 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SIM2Q14190 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIM2Q14190 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SIM2Q14190 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIM2Q14190 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIM2Q14190 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIM2Q14190 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SIM2Q14190 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIM2Q14190 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIM2Q14190 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIM2Q14190 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIM2Q14190 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIM2Q14190 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIM2Q14190 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SIM2Q14190 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SIM2Q14190 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIM2Q14190 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIM2Q14190 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIM2Q14190 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIM2Q14190 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIM2Q14190 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIM2Q14190 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIM2Q14190 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIM2Q14190 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIM2Q14190 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIM2Q14190 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIM2Q14190 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIM2Q14190 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIM2Q14190 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIM2Q14190 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIM2Q14190 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIM2Q14190 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIM2Q14190 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SIM2Q14190 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIM2Q14190 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SIM2Q14190 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIM2Q14190 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIM2Q14190 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIM2Q14190 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIM2Q14190 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIM2Q14190 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIM2Q14190 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIM2Q14190 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIM2Q14190 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIM2Q14190 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SIM2Q14190 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIM2Q14190 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIM2Q14190 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIM2Q14190 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SIM2Q14190 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIM2Q14190 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIM2Q14190 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIM2Q14190 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIM2Q14190 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIM2Q14190 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SIM2Q14190 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SIM2Q14190 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIM2Q14190 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIM2Q14190 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIM2Q14190 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIM2Q14190 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms