Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A1Q07837 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC3A1Q07837 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A1Q07837 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A1Q07837 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC3A1Q07837 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC3A1Q07837 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC3A1Q07837 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC3A1Q07837 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC3A1Q07837 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC3A1Q07837 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC3A1Q07837 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC3A1Q07837 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC3A1Q07837 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC3A1Q07837 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC3A1Q07837 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC3A1Q07837 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC3A1Q07837 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC3A1Q07837 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC3A1Q07837 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC3A1Q07837 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC3A1Q07837 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC3A1Q07837 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC3A1Q07837 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC3A1Q07837 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC3A1Q07837 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC3A1Q07837 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC3A1Q07837 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC3A1Q07837 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC3A1Q07837 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC3A1Q07837 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC3A1Q07837 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC3A1Q07837 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC3A1Q07837 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC3A1Q07837 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC3A1Q07837 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A1Q07837 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC3A1Q07837 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC3A1Q07837 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms