Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HERVK_113P62684 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HERVK_113P62684 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HERVK_113P62684 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HERVK_113P62684 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HERVK_113P62684 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
HERVK_113P62684 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
HERVK_113P62684 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HERVK_113P62684 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HERVK_113P62684 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HERVK_113P62684 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HERVK_113P62684 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
HERVK_113P62684 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HERVK_113P62684 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HERVK_113P62684 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HERVK_113P62684 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HERVK_113P62684 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HERVK_113P62684 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
HERVK_113P62684 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HERVK_113P62684 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HERVK_113P62684 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HERVK_113P62684 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HERVK_113P62684 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HERVK_113P62684 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HERVK_113P62684 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HERVK_113P62684 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HERVK_113P62684 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
HERVK_113P62684 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HERVK_113P62684 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HERVK_113P62684 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HERVK_113P62684 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HERVK_113P62684 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HERVK_113P62684 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HERVK_113P62684 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HERVK_113P62684 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HERVK_113P62684 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HERVK_113P62684 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HERVK_113P62684 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HERVK_113P62684 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HERVK_113P62684 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HERVK_113P62684 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HERVK_113P62684 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HERVK_113P62684 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HERVK_113P62684 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HERVK_113P62684 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HERVK_113P62684 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HERVK_113P62684 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HERVK_113P62684 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HERVK_113P62684 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HERVK_113P62684 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HERVK_113P62684 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HERVK_113P62684 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HERVK_113P62684 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HERVK_113P62684 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HERVK_113P62684 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HERVK_113P62684 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HERVK_113P62684 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HERVK_113P62684 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HERVK_113P62684 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HERVK_113P62684 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HERVK_113P62684 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HERVK_113P62684 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HERVK_113P62684 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HERVK_113P62684 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HERVK_113P62684 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HERVK_113P62684 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
HERVK_113P62684 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HERVK_113P62684 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
HERVK_113P62684 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
HERVK_113P62684 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
HERVK_113P62684 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HERVK_113P62684 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HERVK_113P62684 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HERVK_113P62684 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
HERVK_113P62684 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HERVK_113P62684 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HERVK_113P62684 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
HERVK_113P62684 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HERVK_113P62684 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms