Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNA4P52798 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFNA4P52798 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFNA4P52798 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFNA4P52798 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNA4P52798 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNA4P52798 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNA4P52798 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA4P52798 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA4P52798 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA4P52798 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNA4P52798 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNA4P52798 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNA4P52798 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA4P52798 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA4P52798 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA4P52798 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA4P52798 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFNA4P52798 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFNA4P52798 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNA4P52798 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNA4P52798 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNA4P52798 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNA4P52798 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA4P52798 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNA4P52798 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNA4P52798 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFNA4P52798 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNA4P52798 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNA4P52798 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA4P52798 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA4P52798 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA4P52798 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA4P52798 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA4P52798 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA4P52798 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA4P52798 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA4P52798 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNA4P52798 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNA4P52798 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNA4P52798 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNA4P52798 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA4P52798 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA4P52798 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA4P52798 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA4P52798 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA4P52798 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms