Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SOX9P48436 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOX9P48436 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SOX9P48436 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SOX9P48436 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOX9P48436 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX9P48436 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOX9P48436 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX9P48436 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOX9P48436 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOX9P48436 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX9P48436 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SOX9P48436 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOX9P48436 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SOX9P48436 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOX9P48436 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOX9P48436 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOX9P48436 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX9P48436 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX9P48436 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SOX9P48436 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SOX9P48436 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX9P48436 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOX9P48436 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX9P48436 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX9P48436 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX9P48436 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX9P48436 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX9P48436 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX9P48436 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX9P48436 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX9P48436 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX9P48436 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOX9P48436 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX9P48436 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX9P48436 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX9P48436 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX9P48436 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX9P48436 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX9P48436 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX9P48436 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX9P48436 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX9P48436 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX9P48436 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX9P48436 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOX9P48436 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOX9P48436 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOX9P48436 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX9P48436 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX9P48436 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SOX9P48436 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOX9P48436 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOX9P48436 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOX9P48436 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX9P48436 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX9P48436 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX9P48436 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX9P48436 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOX9P48436 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX9P48436 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOX9P48436 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SOX9P48436 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SOX9P48436 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX9P48436 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX9P48436 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SOX9P48436 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOX9P48436 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOX9P48436 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SOX9P48436 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX9P48436 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX9P48436 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX9P48436 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX9P48436 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX9P48436 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SOX9P48436 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX9P48436 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX9P48436 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX9P48436 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX9P48436 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX9P48436 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX9P48436 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOX9P48436 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOX9P48436 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOX9P48436 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOX9P48436 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOX9P48436 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX9P48436 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX9P48436 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOX9P48436 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOX9P48436 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOX9P48436 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOX9P48436 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOX9P48436 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOX9P48436 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOX9P48436 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOX9P48436 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOX9P48436 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX9P48436 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOX9P48436 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOX9P48436 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms