Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATRXP46100 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATRXP46100 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATRXP46100 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
ATRXP46100 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATRXP46100 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATRXP46100 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATRXP46100 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRXP46100 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRXP46100 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATRXP46100 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATRXP46100 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATRXP46100 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATRXP46100 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATRXP46100 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATRXP46100 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATRXP46100 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATRXP46100 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATRXP46100 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRXP46100 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRXP46100 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRXP46100 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATRXP46100 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATRXP46100 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRXP46100 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRXP46100 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRXP46100 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRXP46100 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRXP46100 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRXP46100 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATRXP46100 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATRXP46100 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATRXP46100 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATRXP46100 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATRXP46100 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATRXP46100 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATRXP46100 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATRXP46100 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATRXP46100 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATRXP46100 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATRXP46100 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATRXP46100 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATRXP46100 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATRXP46100 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATRXP46100 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATRXP46100 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATRXP46100 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATRXP46100 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATRXP46100 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATRXP46100 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATRXP46100 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATRXP46100 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATRXP46100 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATRXP46100 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATRXP46100 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRXP46100 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRXP46100 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATRXP46100 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRXP46100 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATRXP46100 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATRXP46100 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATRXP46100 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATRXP46100 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATRXP46100 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATRXP46100 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRXP46100 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATRXP46100 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATRXP46100 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATRXP46100 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRXP46100 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRXP46100 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRXP46100 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATRXP46100 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATRXP46100 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATRXP46100 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATRXP46100 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATRXP46100 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATRXP46100 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATRXP46100 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATRXP46100 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATRXP46100 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRXP46100 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRXP46100 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRXP46100 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRXP46100 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATRXP46100 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRXP46100 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRXP46100 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRXP46100 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATRXP46100 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRXP46100 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATRXP46100 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRXP46100 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRXP46100 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATRXP46100 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRXP46100 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATRXP46100 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRXP46100 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATRXP46100 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRXP46100 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms