Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
COPB2P35606 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
COPB2P35606 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
COPB2P35606 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COPB2P35606 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COPB2P35606 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
COPB2P35606 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COPB2P35606 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
COPB2P35606 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
COPB2P35606 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COPB2P35606 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
COPB2P35606 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
COPB2P35606 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COPB2P35606 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COPB2P35606 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COPB2P35606 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COPB2P35606 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COPB2P35606 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
COPB2P35606 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
COPB2P35606 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COPB2P35606 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
COPB2P35606 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
COPB2P35606 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
COPB2P35606 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
COPB2P35606 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COPB2P35606 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COPB2P35606 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COPB2P35606 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
COPB2P35606 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
COPB2P35606 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
COPB2P35606 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
COPB2P35606 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
COPB2P35606 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COPB2P35606 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
COPB2P35606 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
COPB2P35606 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
COPB2P35606 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
COPB2P35606 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
COPB2P35606 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
COPB2P35606 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
COPB2P35606 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
COPB2P35606 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
COPB2P35606 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
COPB2P35606 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
COPB2P35606 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
COPB2P35606 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
COPB2P35606 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
COPB2P35606 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
COPB2P35606 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
COPB2P35606 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COPB2P35606 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COPB2P35606 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COPB2P35606 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
COPB2P35606 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
COPB2P35606 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
COPB2P35606 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COPB2P35606 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COPB2P35606 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COPB2P35606 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
COPB2P35606 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
COPB2P35606 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
COPB2P35606 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
COPB2P35606 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
COPB2P35606 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
COPB2P35606 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
COPB2P35606 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
COPB2P35606 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
COPB2P35606 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
COPB2P35606 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
COPB2P35606 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
COPB2P35606 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
COPB2P35606 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
COPB2P35606 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
COPB2P35606 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
COPB2P35606 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
COPB2P35606 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
COPB2P35606 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
COPB2P35606 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
COPB2P35606 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
COPB2P35606 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
COPB2P35606 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
COPB2P35606 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
COPB2P35606 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
COPB2P35606 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
COPB2P35606 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
COPB2P35606 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
COPB2P35606 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COPB2P35606 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
COPB2P35606 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
COPB2P35606 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
COPB2P35606 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
COPB2P35606 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
COPB2P35606 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
COPB2P35606 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
COPB2P35606 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
COPB2P35606 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
COPB2P35606 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
COPB2P35606 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
COPB2P35606 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COPB2P35606 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms