Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP5DP30049 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP5DP30049 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP5DP30049 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP5DP30049 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP5DP30049 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP5DP30049 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP5DP30049 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP5DP30049 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP5DP30049 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP5DP30049 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP5DP30049 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP5DP30049 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP5DP30049 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP5DP30049 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP5DP30049 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP5DP30049 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP5DP30049 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP5DP30049 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP5DP30049 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP5DP30049 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP5DP30049 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP5DP30049 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP5DP30049 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP5DP30049 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP5DP30049 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP5DP30049 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP5DP30049 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP5DP30049 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP5DP30049 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP5DP30049 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP5DP30049 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP5DP30049 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP5DP30049 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP5DP30049 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP5DP30049 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP5DP30049 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP5DP30049 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP5DP30049 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP5DP30049 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP5DP30049 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP5DP30049 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP5DP30049 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP5DP30049 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP5DP30049 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP5DP30049 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP5DP30049 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP5DP30049 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP5DP30049 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP5DP30049 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP5DP30049 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP5DP30049 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms