Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALRP27797 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALRP27797 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALRP27797 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALRP27797 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALRP27797 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALRP27797 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALRP27797 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALRP27797 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALRP27797 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALRP27797 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALRP27797 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALRP27797 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALRP27797 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALRP27797 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALRP27797 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALRP27797 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALRP27797 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALRP27797 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALRP27797 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALRP27797 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALRP27797 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALRP27797 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALRP27797 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CALRP27797 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALRP27797 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALRP27797 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALRP27797 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALRP27797 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALRP27797 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALRP27797 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALRP27797 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALRP27797 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALRP27797 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALRP27797 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALRP27797 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALRP27797 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALRP27797 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALRP27797 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALRP27797 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALRP27797 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALRP27797 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALRP27797 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALRP27797 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALRP27797 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALRP27797 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALRP27797 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALRP27797 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALRP27797 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALRP27797 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALRP27797 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALRP27797 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALRP27797 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALRP27797 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALRP27797 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALRP27797 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALRP27797 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALRP27797 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALRP27797 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALRP27797 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALRP27797 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALRP27797 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALRP27797 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALRP27797 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALRP27797 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALRP27797 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALRP27797 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALRP27797 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALRP27797 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALRP27797 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALRP27797 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALRP27797 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALRP27797 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALRP27797 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CALRP27797 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALRP27797 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALRP27797 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALRP27797 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALRP27797 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALRP27797 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CALRP27797 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALRP27797 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALRP27797 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALRP27797 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALRP27797 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALRP27797 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALRP27797 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALRP27797 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALRP27797 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALRP27797 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALRP27797 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALRP27797 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALRP27797 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALRP27797 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALRP27797 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALRP27797 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALRP27797 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALRP27797 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CALRP27797 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALRP27797 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms