Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX1P15863 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX1P15863 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX1P15863 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAX1P15863 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAX1P15863 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAX1P15863 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX1P15863 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX1P15863 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX1P15863 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX1P15863 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PAX1P15863 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PAX1P15863 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAX1P15863 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAX1P15863 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAX1P15863 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAX1P15863 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAX1P15863 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAX1P15863 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PAX1P15863 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAX1P15863 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAX1P15863 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAX1P15863 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAX1P15863 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAX1P15863 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PAX1P15863 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX1P15863 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX1P15863 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX1P15863 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX1P15863 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX1P15863 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX1P15863 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX1P15863 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAX1P15863 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX1P15863 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX1P15863 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAX1P15863 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX1P15863 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX1P15863 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX1P15863 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX1P15863 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX1P15863 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAX1P15863 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX1P15863 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX1P15863 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX1P15863 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX1P15863 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX1P15863 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX1P15863 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX1P15863 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX1P15863 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX1P15863 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX1P15863 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX1P15863 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX1P15863 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX1P15863 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX1P15863 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX1P15863 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX1P15863 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX1P15863 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX1P15863 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX1P15863 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX1P15863 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAX1P15863 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX1P15863 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX1P15863 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX1P15863 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX1P15863 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX1P15863 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX1P15863 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAX1P15863 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAX1P15863 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX1P15863 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX1P15863 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX1P15863 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX1P15863 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAX1P15863 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX1P15863 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX1P15863 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX1P15863 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX1P15863 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX1P15863 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX1P15863 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX1P15863 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX1P15863 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX1P15863 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX1P15863 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX1P15863 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX1P15863 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX1P15863 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAX1P15863 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX1P15863 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX1P15863 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX1P15863 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX1P15863 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX1P15863 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX1P15863 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX1P15863 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX1P15863 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX1P15863 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms