Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTA3P0C7M3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTA3P0C7M3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTA3P0C7M3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTA3P0C7M3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTA3P0C7M3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTA3P0C7M3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTA3P0C7M3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTA3P0C7M3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTA3P0C7M3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTA3P0C7M3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTA3P0C7M3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTA3P0C7M3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTA3P0C7M3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTA3P0C7M3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTA3P0C7M3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTA3P0C7M3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTA3P0C7M3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTA3P0C7M3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTA3P0C7M3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTA3P0C7M3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTA3P0C7M3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTA3P0C7M3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTA3P0C7M3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTA3P0C7M3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTA3P0C7M3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTA3P0C7M3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTA3P0C7M3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTA3P0C7M3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTA3P0C7M3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTA3P0C7M3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTA3P0C7M3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTA3P0C7M3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTA3P0C7M3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTA3P0C7M3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTA3P0C7M3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTA3P0C7M3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTA3P0C7M3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTA3P0C7M3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTA3P0C7M3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFTA3P0C7M3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTA3P0C7M3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTA3P0C7M3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTA3P0C7M3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTA3P0C7M3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTA3P0C7M3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTA3P0C7M3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTA3P0C7M3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTA3P0C7M3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTA3P0C7M3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTA3P0C7M3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFTA3P0C7M3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms