Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG5P05408 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG5P05408 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG5P05408 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG5P05408 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG5P05408 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG5P05408 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG5P05408 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG5P05408 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCG5P05408 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG5P05408 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG5P05408 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG5P05408 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG5P05408 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG5P05408 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG5P05408 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG5P05408 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG5P05408 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG5P05408 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG5P05408 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG5P05408 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG5P05408 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG5P05408 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG5P05408 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG5P05408 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCG5P05408 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCG5P05408 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCG5P05408 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCG5P05408 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCG5P05408 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG5P05408 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG5P05408 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG5P05408 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG5P05408 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG5P05408 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG5P05408 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG5P05408 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG5P05408 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG5P05408 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG5P05408 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG5P05408 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG5P05408 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG5P05408 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG5P05408 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG5P05408 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG5P05408 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG5P05408 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG5P05408 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG5P05408 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG5P05408 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG5P05408 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG5P05408 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG5P05408 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG5P05408 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG5P05408 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG5P05408 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCG5P05408 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCG5P05408 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG5P05408 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG5P05408 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG5P05408 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG5P05408 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG5P05408 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG5P05408 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG5P05408 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG5P05408 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG5P05408 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG5P05408 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG5P05408 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG5P05408 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG5P05408 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG5P05408 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG5P05408 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG5P05408 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG5P05408 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG5P05408 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG5P05408 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG5P05408 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG5P05408 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG5P05408 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG5P05408 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG5P05408 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG5P05408 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG5P05408 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG5P05408 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG5P05408 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG5P05408 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCG5P05408 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG5P05408 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG5P05408 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG5P05408 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG5P05408 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG5P05408 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG5P05408 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG5P05408 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG5P05408 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG5P05408 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG5P05408 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG5P05408 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG5P05408 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms