Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KT08 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KT08 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KT08 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KT08 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KT08 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KT08 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KT08 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KT08 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
J3KT08 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
J3KT08 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KT08 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
J3KT08 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
J3KT08 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KT08 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KT08 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
J3KT08 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3KT08 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3KT08 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
J3KT08 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
J3KT08 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3KT08 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3KT08 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
J3KT08 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KT08 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
J3KT08 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
J3KT08 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KT08 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3KT08 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3KT08 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3KT08 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3KT08 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KT08 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3KT08 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3KT08 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KT08 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KT08 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KT08 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KT08 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KT08 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KT08 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KT08 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
J3KT08 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3KT08 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3KT08 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3KT08 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KT08 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3KT08 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3KT08 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3KT08 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
J3KT08 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
J3KT08 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3KT08 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3KT08 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3KT08 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3KT08 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3KT08 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3KT08 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3KT08 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3KT08 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3KT08 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3KT08 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KT08 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KT08 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3KT08 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KT08 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KT08 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3KT08 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KT08 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KT08 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KT08 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KT08 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3KT08 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KT08 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3KT08 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KT08 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3KT08 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3KT08 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3KT08 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3KT08 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3KT08 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
J3KT08 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
J3KT08 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
J3KT08 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
J3KT08 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
J3KT08 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
J3KT08 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3KT08 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3KT08 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3KT08 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3KT08 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3KT08 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3KT08 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3KT08 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3KT08 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3KT08 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3KT08 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3KT08 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KT08 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3KT08 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms