Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C4orf47A7E2U8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C4orf47A7E2U8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4orf47A7E2U8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C4orf47A7E2U8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C4orf47A7E2U8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C4orf47A7E2U8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4orf47A7E2U8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
C4orf47A7E2U8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4orf47A7E2U8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4orf47A7E2U8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4orf47A7E2U8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4orf47A7E2U8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4orf47A7E2U8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4orf47A7E2U8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4orf47A7E2U8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C4orf47A7E2U8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4orf47A7E2U8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4orf47A7E2U8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C4orf47A7E2U8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C4orf47A7E2U8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4orf47A7E2U8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4orf47A7E2U8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4orf47A7E2U8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4orf47A7E2U8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4orf47A7E2U8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4orf47A7E2U8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4orf47A7E2U8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4orf47A7E2U8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4orf47A7E2U8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
C4orf47A7E2U8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C4orf47A7E2U8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C4orf47A7E2U8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C4orf47A7E2U8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C4orf47A7E2U8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C4orf47A7E2U8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C4orf47A7E2U8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C4orf47A7E2U8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C4orf47A7E2U8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4orf47A7E2U8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C4orf47A7E2U8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C4orf47A7E2U8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C4orf47A7E2U8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C4orf47A7E2U8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C4orf47A7E2U8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C4orf47A7E2U8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4orf47A7E2U8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4orf47A7E2U8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C4orf47A7E2U8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C4orf47A7E2U8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C4orf47A7E2U8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4orf47A7E2U8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4orf47A7E2U8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4orf47A7E2U8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4orf47A7E2U8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4orf47A7E2U8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4orf47A7E2U8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4orf47A7E2U8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4orf47A7E2U8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4orf47A7E2U8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4orf47A7E2U8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4orf47A7E2U8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4orf47A7E2U8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4orf47A7E2U8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms