Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
TMEFF2Q9UIK5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEFF2Q9UIK5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms