Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms