Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SACSQ9NZJ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SACSQ9NZJ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms