Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PREBQ9HCU5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PREBQ9HCU5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms