Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM74Q96NL1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM74Q96NL1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms