Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms