Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
STRCQ7RTU9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
STRCQ7RTU9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
STRCQ7RTU9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms