Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIMM23BQ5SRD1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIMM23BQ5SRD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIMM23BQ5SRD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIMM23BQ5SRD1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIMM23BQ5SRD1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM23BQ5SRD1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM23BQ5SRD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms