Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX3Q13761 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX3Q13761 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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