Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE1BQ01064 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms