Protein–RNA interactions for Protein: P58417

NXPH1, Neurexophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH1P58417 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPH1P58417 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms