Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP13P45452 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP13P45452 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP13P45452 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP13P45452 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP13P45452 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP13P45452 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP13P45452 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP13P45452 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP13P45452 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP13P45452 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP13P45452 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP13P45452 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP13P45452 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP13P45452 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP13P45452 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP13P45452 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP13P45452 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP13P45452 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP13P45452 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP13P45452 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms